目前在在销售的荧光染料主要有几大类包括有：CY系列菁染料，Bodipy系列染料，香豆素及双光子香豆素系列染料，近红外区域IR系列，ICG系列染料，TO噻唑橙系列染料，PH敏感型荧光染料。

产品一：CY3/CY3.5/CY5/CY5.5.CY7.5

菁染料是近红外荧光染料中最常用的一类荧光染料，统的可见光染料相比有显著的优势。由于细胞和组织的自发荧光在近红外波段最小，因此在检测复杂生物系统时，近红外染料能提供更高的特异性和灵敏度。同时，由于光波在近红外区段的组织透过性更好。菁染料的摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的，Cy7 NHS ester, Cy5.5 amine 和Cy3 azide 的吸收在近红外区背景非常低，是荧光强度最高、最稳定的长波长染料。特别适合于活体小动物体内成像代替放射性元素。

CY花菁染料的优点：

1：菁染料的摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的

2：细胞和组织的自发荧光在近红外波段最小

3：更高的特异性和灵敏度

4：光波在近红外区段的组织透过性更好

5：染料细胞毒性小 可用于标记抗体 蛋白 细胞。

因此CY花菁染料是非常适合做小鼠活体成像的荧光染料

CY花菁染料的缺点：

1：菁染料的荧光量子效率相比其他染料较低，一般是0.1-0.2

2：多川结构的菁染料容易发生聚集

CY花菁染料的价格特点：

目前市面上的菁染料价格比较高，主要是因为菁染料, 尤其是不对称菁染料的合成副反应多, 副产物极性相近, 产物的分离提纯相当困难。菁染料特别是水溶性菁染料分子极性大, 分离提纯越加困难，因此带磺酸根的水溶花菁染料比脂溶的贵一些。